La UGC cuenta con varias unidades asistenciales:
- Unidad de endoscopias
- Unidad de Hepatología y Trasplante Hepático
- Unidad de Enfermedad Inflamatoria Intestinal
- Unidad de pruebas funcionales y trastornos motores
- Unidad de Alto Riesgo
- Unidad de Páncreas