Los grupos de investigación reconocidos por el Plan Andaluz de Investigación, Desarrollo e Innovación (PAIDI) son:
| Código | Nombre del Grupo | Servicio |
| CTS 467 | Células madre, Trasplante, virus y cáncer | Anatomía patológica |
| CTS 959 | Medicina Perioperatoria, Dolor | Anestesia |
| CTS 481 | Fracaso Multiorgánico | Cirugía General |
| CTS-1064 | Genética cardiovascular y Arritmias | Cardiología |
| CTS 479 | Cáncer Cavidad Oral | Cirugía Maxilofacial |
| CTS 613 | Fisura labio palatina | Cirugía Maxilofacial |
| CTS 957 | Cirugía y endocirugia vascular | Cirugía Vascular |
| CTS 240 | Oncología cutánea | Dermatología |
| CTS 537 | Aparato Digestivo | Digestivo |
| CTS 534 | Farmacéuticos hospitalarios del HUVN | Farmacia Hospitalaria |
| CTS 596 | Infecciones en pacientes oncohematológicos | Hematología |
| CTS 610 | Enfermedades Infecciosas | Infecciosos |
| CTS 213 | TIC, Comunicaciones e Ingeniería aplicadas a la Salud | Informática/Neumología/Física y Protección Radiológica |
| CTS 143 | Inmunología | Laboratorio |
| CTS 342 | Lupus | Medicina Interna |
| CTS 536 | Medicina Nuclear y Molecular | Medicina Nuclear |
| CTS 223 | Microbiología | Microbiología |
| CTS 513 | Enfermedad de Parkinson y trastornos movimiento | Neurología |
| CTS 568 | Neurología Clínica y Neuroepidemiología | Neurología |
| CTS 504 | Nutrición Clínica | Nutrición Clínica |
| CTS 340 | Obstetricia y Ginecología | Obstetricia y Ginecología |
| CTS 486 | Medicina Basada en la Evidencia | Oncología |
| CTS 514 | Oncología médica | Oncología |
| CTS 955 | Oncología básica y Clínica | Oncología |
| CTS 495 | Otología y Otoneurología | Otorrinolaringología |
| CTS 943 | Otorrinolaringología avanzada | Otorrinolaringología |
| CTS 535 | Seguimiento del niño con patología crónica | Pediatría |
| CTS 565 | F. Pronósticos, Clínicos e Inmunológico de las Enfermedades Reumáticas | Reumatología |
| CTS 533 | Cirugía ortopédica y traumatología | Traumatología |
| CTS 354 | Aplicabilidad de la Biol. Molecular a tumores: riñón, vejiga y próstata. | Urología |